Paddington pergi ke Peru untuk mengunjungi bibi kesayangannya, Aunt Lucy, yang sekarang tinggal di Rumah Pensiunan Beruang. Bersama keluarga Brown, sebuah petualangan menegangkan dimulai ketika sebuah misteri mendorong mereka pada dalam sebuah perjalanan tak terduga melalui hutan hujan Amazon dan puncak pegunungan Peru.